1、肛门腺感染
肛窦位于肛管与直肠的交界处，呈漏斗状向上开口，易受损伤，且损伤后，易因细菌的侵入而引发感染。肛门腺开口于肛窦内，肛窦一旦感染就会引起肛门腺感染化脓，炎症就会逐渐向肛周的间隙内扩散。因为肛周间隙抵御感染的能力差，感染非常易于在这些间隙中扩散。2、全身抵抗力下降
患有糖尿病或结核病等病、年老体弱、过度疲劳的人往往抵抗力较差，更易患有此病。
3、肛门局部刺激和损伤
如经常吃辣椒、喝酒等刺激性食物会导致肛管直肠局部充血，局部抵抗力降低而易引发感染。另外，干硬的粪便擦伤肛管皮肤黏膜，腹泻患者的稀便落在肛窦内导致肛门腺管阻塞，肛门直肠外伤或被不小心吞咽下的鸡、鸭、鱼骨刺伤肛管直肠等，均可导致肛门直肠周围发生感染而形成肛管直肠周围脓肿。
4、来源于肛门直肠的其他疾病
有的来源于内外痔疮的感染、肛裂或肛周皮肤感染，有的则来源于肛门部外伤或手术，极少数由结核溃疡性结肠炎或克罗恩病（一种局限性肠炎）引起。
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